تجميعه مهمه في البيو

بسم الله الرحمن الرحيم




السلام عليكم و رحمة الله وبركاته




طبعا كلكو شايفين اد ايه الفرع ده مهم و طويل وبناخد منه كم كبير ف المحاضرات .....

علشان كدة قررت اني اعمل الموضوع ده خاصة لما لاقيت الدكتور ربنا يجزيه كل خير بيلغي استركشرز كتير
و بيركز علي نقط معينة
فان شاء الله هاحاول اجمع هنا الحاجات اللي قال عليها مش مهم نحفظ الاستركشرز بتاعتها
و الاسئلة المهمة و التجميعات اللي بيقولها في نهاية المحاضرة
ولو في حاجة جمعها بطريقة سهلة هاحاول اكتبها برضه ان شاء الله
علشان لو حد مش عنده وقت يسمع المحاضرات كلها او سمعها و عاوز يأكد ع الحاجات المهمة
و ياريت لو حد عنده اضافة علي اللي هاكتبه ميبخلش علينا بيها .....









و هابدأ ان شاء الله بالglycine

و هابدأفيه بنقط قالها مش مكتوبة في المذكرة اللي بذاكر منها لكن هتفمك اكتر

اول حاجة هو الaaالوحيد اللي optically inactive
لانه مش عنده asymetrical carbon atom


بالنسبة لوظيفة glutathione الخاصة بالinsulin inactivation
احنا اصلا محتاجين نعمله inactivation ليه ؟؟
علشان فترة نصف العمر للانسولين ف الجسم لازم تكون صغيرة والا هيزيد نشاطه اوي
و يسبب hypoglycemia


بالنسبة للsynthesis of creatine and creatinine
قال افتكروها دايما بتلاتة aa و تلاتة sites
ال3aa هما methionine & arginine & glycine
ال3sitesهما kid & liver & ms

بالنسبة للglycine threonine cycle ازاي اعتبرناها من ضمن الcatabolic fates ؟؟؟؟
افترضوا دايما ان الcycle بادئة من عند acetyle coa
و انتهت برضه عند ال acetyle coa
يبقي اي حاجة اتضافت ف الpathway حصلها catabolism
و اولها ال glycine اللي اتحول لمكوناته الاصلية وهي
co2 اللي خرج اثناء تكوين ال amino acetone و ال acetyle coa
nh3 اللي خرج اثناء تكوين glyoxal





الحاجات اللي مش لازم يتحفظ الاستركشرز بتاعها
synthesis of bile salts
detoxication reactions

glycine succinate cycle كان الدكتور لخصها بطريقة جميلة
احفظوها
* compination between glycine&succinyl coa to give delta amino leveulenic acid
*delta amino leveulenic acid has 2 fates
Haem formation (( anabolic)) a
succinyl coa ((catabolic)) ..... How ??b
ALA converted into alpha keto glutraldhyde by deamination
alphaketoglutaraldhyde converted into alphaketoglutaric by oxidation
alphaketoglutaric converted into succinyle coa by oxidative decarboxylation

sites of cleavage
first co2 removed during ala synthesis
amino removed during alphaketoglutaraldhyde synthesis
second co2 removed during succinyle coa synthesis

نيجي للاسئلة بقي
اكتر سؤال صعب الدكتور قاله
role of glycine in lipid metabolism??
الاجابة اننا نتكلم عن الحنة بتاعة الbile acids
و نزود عليها دور الbileفي lipid digestion اللي كان ف اول الlipid خالص (فاكرينه...؟)



اهم الاسئلة ف الglycine
1) synthesis of glycine ؟؟؟؟
2) enumerate anablic fate of glycine and discuss 2 of them ؟؟؟
3)enumerate catablic fate of glycine and discuss 2 of them ????
4) inborn errors of glycine metabolism ????
5) sources and fates of glyoxalic acid???
6) discuss biochemical leison of glycine metabolism???
السؤال الاخير ده معناه الامراض اللي ليها اصل كيميائي الناتجة عن قصور ف ال glycine metabolism
يعني هو هواه الinborn errors
و اي سؤال biochemical leison يتجاوب في تلات نقط
enz defect
biochemical finding (( تفكر ف مكانين يا اما الurine او ال blood ))
manifestation



____________________________________
ثانيا الalanine
اولا عاوزين نتفق علي حاجتين
انه الalanine بدون القاب كدة يبقي المقصود بيه alpha alanine
و تاني حاجة ان اي حاجة بتدي pyruvic يبقي هتديلنا alanine

بالنسبة لل alanine biosynthesis
بينتج بطريقين طريق مباشر و غير مباشر
الطريق المباشر ليه 3 احتمالات
اما من pyruvic by transamination
او من tryptophan during niacin synthesis
او من tyrosin during thyroxin synthesis
الطريق الغير مباشر ليه احتمالات كتييييييييير (( لاننا اتفقنا ان اي حاجة بتدي pyruvic يبقي هتديلنا alanine ))
و امثلة
من serine & cystiene &........




functions of alpha alanin

1) share in protien structure "دي بنكتبها ف اي امينو اسيد "

2) enter in formation of pyruvic acid and then gluconeogenesis
alanin is cnverted to pyruvic by 3 methods :2 direct methodes through transamination and oxidative deamination
the 3rd methode is glucose alanin cycle


_______________________________


بالنسبة للbeta alanine
لازم نعرف الاول انه non protien forming a.a.((يعني مش بيدخل ف تركيب البروتين))

بالنسبة للsynthesis
1) from aspartic acid
2) from pyrimidines
3) from carnosine through carnosinase

functions:
***formation of pantothenic acid ((formed of beta alanine and thioethanolamine having thiole group which share in formation of coash

****formation of certain dipeptides as follow
histidine +betaalanine ======carnosin============by methylation gives anserine

functions of carnosine:::=======activate atpase & help ms to take cu &act as buffer due to containing amino group


betaalanin catabolism ملغية








سؤالين ع الalanine
sources of alanine
sources &fates of beta alanine


__________________________________
نبدأ مع ال serine & threonine
الحاجات المشتركة ما بينهم
1)hydroxy containing aa
2)enter in ptn synthesis
3)phospho ptn formation"via oh group

threonine ====mixed"glucogenic&ketogenic

بالنسبة للcholine cycle
مش لازم نحفظ الخطوات اللي بعد betaine , قول بيدي glycine و خلاص
و كمان مشيها محطات اسهل
serine====ethanlamine=====choline=====betaine aldhyde====betaine========glycine


اهم الاسئلة في ال serine &threonine
role of serine in lipid metabolism""مهم جدااااااااااااااااااااااا
اجابته ف المرفقات
role of serine in phosphoptn metabolism
الاجابة
oh of serine is site of attachment for phosphoric group in phosphoptn metabolism glycoptn



باقي الاسئلة
(( اللي مش عارف الاجابة يقول و انا اكتبها ))

enumerate 2 glucogenic pathways of threonine

derivatives and functions of oh containing aa

discuss role of oh containing aa in phospholi[id & phospho ptn

threonine is mixed aa >>how

enumerate anabolic fates of serineand discuss 2 of them

biotransformation of glucose6p to serine

(( ممكن يجيب اي مركب تاني من الglycolysisمكان الglucose6p ذي ال 3pg.........))

و برضه اسئلة الcholine cycle مش هتيجي مباشرة
لكن هتكون في صورة

biotransformation

__________________________

theronine is mixed
الجزء التاني من الموضوع

theronine is mixed

هو mixed لانه glucogenic& ketogenic :
glucogenic
و ده له طريقين
1) اما مباشرة عن طريق تحوله لsuccinyle coa بواسطة threonine dehydratase
2) عن طريق تحوله للglycine ثم serine و بعدين يحصل non oxidative deamination

ketogenic
و ده عن طريق glycine threonine cycle لما كان بيدي ف الاخرacetyle coa

___________________________________________

Phenylalanine

Discuss fates of phenylalanine

key answer::::

It has 2 pathways
Main ===========to give tyrosine
Minor pathway===========when absence of phenylalanine hydroxylase enz or absence of tetrahydro bioptin =====in this case phenylalanine converted into phenyle pyruvic by transamination ======then reduced to phenylelactate ======then converted to phenylacetate by decarboxylation
and this case known as phenyl ketonurea


_____________________________________________



Tyrosine

بالنسبة لل melanine
مش مطلوب مننا استركشر بعد DOPA
الباقي اسماء بس

بالنسبة للputrefaction
مطلوب اننا نعرف انه بيحصل فيه
decarboxylation & deamination
وفي الاخر بيدي phenole
بس مش لازم نحفظ استركشرز


catabolism of catecholamines is caused by MAO((Monoamine oxidase))I

التفاعلات اللي بتعتمد علي ال hydroxylase enz هي تفاعلين :
تكوين ال DOPA
&تكوين homogentisic acid



من استخدامات ال DOPA::::
يستخدم في علاج ال barkinsonism (( لان المرض ده عبارة عن نقص في ال neurotransmitters ))


من استخدامات ال methyle DOPA :::::
inhibit DOPA decarboxylase enz and as aresult prevent formation of dopamine &NA &A . It's used in treatment of sympathetic overactivity

__________________________________________________
اهم الاسئلة


## Enumerate aa which form neurotransmitters and discuss one of them???
====== glutamic & histidine& tyrosine
tryptophan&

السؤال الجاي مهم جدااااااااااااااااااا
### catabolic fate of tyrosine=illustrate glucogenis and ketogenic pathways of tyrosine= homogentisic acid pathway = synthesis & fates of homogentisic acid????

طبعا كل ال
inborn errors
اهم من بعضها
و ممكن ييجي سؤال علي كذا حاجة مع بعض
زي كدة مثلا
### Tyrosinemias???
هتتكلم ع ال3 انواع


### Tetrahydro bioptenin dependent reactions ???
هنتكلم علي
phenylalanine to tyrosine
& tyrosine to DOPA and catecholamines


#### Biotransformation of phenylalanine to T3???

### Synthesis & fates of DOPA???
و السؤال ده له جزئين
لو في***
SRG
يبقي هنتكلم عن ال
catecholamines
وتقول انها
tetre hydro bioptenin dependent reaction

** ولو في ال
melanocytes
هتتكلم عن
melanine
وتقول انها
cu dependent


____________________________

Tryptophan

بالنسبة لل argentifinoma ( او اي مرض يعني)
لو سألك عن ال biochemical findings
هتقول الحاجات اللي بتظهر ف اليورين والbl
ولو سأل عنه clinically
هتقول اللي بيحصل فيه يعني بالنسبة لل argentifinoma هتبقي
increase conversion of tryptophan to serotonine & so decrease conversion to niacin leading to pellagra


بالنسبة لل niacin synthesis
مش مطلوب كل التفاعلات
كفايا لغاية 3OH anthranilic acid
و بعدين تقول
by 3OH anthranilic acid dioxygenase and sequence of reactions to give nicotinic acid then nicotinamide


بالنسبة لل puterfaction
الاستركشرز مطلوبة لغاية ال indole ، بعد كدة اسماء فقط
و عامة هو نفس فكرة ال puterfaction اللي اخدناه ف ال tyrosine
يعني الاول بيحصل reductive deamination

وبعد كدة decarboxylation

___________________________________

serotonine
يعتبر stimulatory neurotransmitter
و ممكن نضيف ال tryptophan للسؤال المجمع اللي ف الاول ده
## Enumerate aa which form neurotransmitters and discuss one of them???



_____________________________


اهم الاسئلة

* Role of aa in bile salts synthesis????
Glycine& Cystiene


* Biotransformation of tryptophan to 3OH anthranilic acid????I
* Synthesis & fates of 3OH anthranilic acid ???I
* Tryptophan is mixed aa???I
glucogenic======give alanine
ketogenic=======give 3OH anthranilic acid w give aceto acetic acid


* Formic acid synthesis???I
glyoxalic acid
tryptophan


*Hartnup disease???I


* Enumerate dioxygenases in aa metabolism ????I
Homogentisic acid pathway
Tryptophan oxygenase
3OH anthranilic acid dioxygenase
Cystiene



____________________________


Cystiene& Cystine

الدكتور شرحهم علي بعض ف حوالي ربع ساعة و مضافش جديد غير
SH group is called ===mercapto=diol=sulpho


و بالنسبة لل selenocystiene
تركيبه هو هواه ال cystiene
بس بدل ال sulfer
selenium

وسؤال تجميعة
From cystiene give pyruvic by 3 methods???I
-non oxidative deamination followed by desulfhydration
-transamination followed by sulfer transfer
-oxidation by dioxygenase ,then formation of sulfinyl pyruvic , then using desulfinase to form pyruvic


_____________________________

methionine
مهم جدااااااااااااااااا

اهم سؤال فيه
glucogenic pathway of methionine????

و بالنسبة لل metabolic functions of methionine هي:
1-ptn synthesis
2 - form sam
3- lipotropic factor((prevent fatty liver
4- formation of homocystiene
5- form cystiene
6 - glucogenic pathway

________________________


اسئلة علي
SULFER CONTAINING AMINO ACIDS

1- AA HAVING ROLE IN COASH SYNTHESIS ????i
(( BETA ALANINE & CYSTIENE


2- FUNCTIONS& DERIVATIVES OF CYSTIENE?????i

3 BIOTRANSFORMATION OF METHIONINE TO CYSTIENE????i

4- BIOTRANSFORMATION OF METHIONINE TO GLUCOSE????i

5- BIOCHEMICAL LEISON OF HOMOCYSTIENUREA????i


____________________________________


ملحوظة :::
methioninr is essential :i.e. Not synthesized in body, but it can be regenerated